Основными задачами Центра являются:

1) Производство судебных экспертиз, а также проведение экспертных исследований в соответствии с законодательством Российской Федерации;

2) Научно-методическое обеспечение, контроль за качеством подготовки, повышения квалификации и аттестации экспертов курируемых СЭУ по экспертным специальностям в области судебной экспертизы в соответствии с нормативными правовыми актами Минюста России.

Для каждого экспертного учреждения Министерства юстиции России установлена зона обслуживания следственных органов и судов. В основном это одна или более (до четырех) областей, краев, республик в составе Российской Федерации. В целях приближения экспертной службы к судебно-следственным органам в некоторых крупных городах образованы филиалы, отделы либо экспертные группы, которые по мере развития преобразуются в самостоятельные ЛСЭ. Каждому экспертному учреждению определен перечень родов и видов судебных экспертиз, обязательных для производства.

ФБУ Уральский РЦСЭ Минюста России курирует лаборатории судебной экспертизы Минюста России Уральской зоны (Челябинскую и Тюменскую). Такой научно-методический контроль устанавливается Минюстом России.

ФБУ Уральский РЦСЭ Минюста России — одно из ведущих экспертных учреждений Министерства юстиции Российской Федерации, база для подготовки экспертов различного профиля для других экспертных учреждений, место постоянного проведения конференций и школ, зональных научно-практических семинаров по всем видам экспертного производства.